日本九州地区拥有众多知名的大学，以下是部分主要大学的列表：
九州大学
位于福冈县福冈市，是日本顶尖的综合研究型国立大学，也是九州地区最高学府。
北九州市立大学
公立大学，位于北九州市，是日本文部科学省指定的牵引国际化人才大学计划的一部分。
九州工业大学
位于福冈县北九州市，是日本历史悠久的理工类院校，工科实力在日本名列前茅。
长崎大学
位于长崎市，是一所历史悠久的综合性国立大学。
熊本大学
位于熊本市，是九州地区著名的国立大学之一。
鹿儿岛大学
位于鹿儿岛市，是一所历史悠久的综合性国立大学。
大分大学
位于大分市，是一所综合性国立大学。
宫崎大学
位于宫崎市，是一所综合性国立大学。
九州齿科大学
位于北九州市，专注于牙科教育与研究。
九州荣养福祉大学
私立大学，专注于福祉领域的教育与研究。
九州女子大学
私立大学，提供女性教育。
产业医科大学
私立大学，专注于医学教育与研究。
西日本工业大学
私立大学，位于北九州市，专注于理工科教育与研究。
福冈大学北九州学术研究都市校区
位于北九州市，是福冈大学的一个校区。
早稻田大学北九州校区
位于北九州市，是早稻田大学的一个校区。
九州电机短期大学
提供短期教育课程。
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